Ecodev a entrepris un processus de décentralisation de ses activités dans les zones géographiques où elle dispose d'une expérience importante à savoir, le Sud-Est (les deux Hodhs et l'Assaba) et la Vallée (Trarza, Brakna, Gorgol et Guidimagha). Aujourd'hui, deux antennes régionales sont opérationelles à Kaédi et à Kiffa. La création d'antennes au niveau des wilayas de l'intérieur est encouragées par la politique actuelle de décentralisation qui s'appuie sur les structures présentes localement, plus à même de comprendre les réalités locales et de valoriser les potentiels et les savoir-faire existants. Le siège, basé à Nouakchott, couvre les actions entreprises sur le littoral.